口腔鳞状细胞癌患者易感基因全基因组关联分析
近期,广西医科大学附属口腔医学院温琦涛等研究了口腔鳞状细胞癌患者易感基因全基因组关联分析,研究发现,HLA-B基因和C19orf45基因可能与口腔鳞状细胞癌的发生相关。该文章发表于2016年02期《临床口腔医学杂志》上。
该研究旨在获得与口腔鳞状细胞癌(OSCC)易感及转移密切相关的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphi-sms,SNP)位点。
研究者们选择10例晚期OSCC患者原发灶及颈淋巴结转移灶组织,24个健康志愿者的外周血样本,提取DNA,采用全基因组外显子测序技术,分析口腔癌发生及转移的易感基因。
结果显示,聚类运算后,将样本分为病例组(原发灶+转移灶)和健康组进行关联分析,初步分析得出622个SNP相关位点,经多重校正,确定2个SNP有意义(P<0.05),查询NCBI数据库Gene确定了为HLA-B基因和C19orf45基因。
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